水生生物學專業早期以研究水生生物的形態、分類和自然生態為主;其后由于個體生態和種群生態研究的開展，生理學、生物化學概念和方法的引入，特別是1935年，英國科學家A.G.坦斯利提出“生態系統”概念以后，水生生物學也有了較完整的“水生態系統”概念。
全國共有20所招收水生生物學專業研究生的學校參與了排名，其中排名的是中山大學，排名第二的是廈門大學，排名第三的是暨南大學，以下是水生生物學專業考研學校排名具體名單：
| 學校排名 | 學校名稱 |
| 1 | 中山大學 |
| 2 | 廈門大學 |
| 3 | 暨南大學 |
| 4 | 華中農業大學 |
| 5 | 上海海洋大學 |
| 6 | 西北農林科技大學 |
| 7 | 南京農業大學 |
| 8 | 南京師范大學 |
| 9 | 華南農業大學 |
| 10 | 同濟大學 |
| 11 | 華南師范大學 |
| 12 | 南昌大學 |
| 13 | 西南大學 |
| 14 | 中國海洋大學 |
| 15 | 湖南農業大學 |
| 16 | 清華大學 |
| 17 | 山西大學 |
| 18 | 海南大學 |
| 19 | 東北林業大學 |
| 20 | 陜西師范大學 |
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