植物保護學科主要是由植物病蟲害專業發展而來的。在國務院學位委員會學科評議組制定和頒布的《授予博士、碩士學位和培養研究生的學科、專業目錄》中，植物保護屬于農學學科門類之中的其中一個一級學科，下設3個二級學科，分別是：植物病理學、農業昆蟲與害蟲防治、農藥學(可授農學、理學學位）。植物保護學科作為農學門類中四個與種植業有關的一級學科之一，具有明顯的跨學科特色。
中國科學評價研究中心、中國科教評價網和中國教育質量評價中心共同完成了2017年度中國大學及學科專業評價工作。本次大學評價共包含2751（去年2742）所中國高等院校。其中包括1200所（去年1155）中國大學（不含軍事類院校和港澳臺地區高校）：含重點大學131所（一流大學26所），一般大學645所（去年621），民辦院校424所（去年403）；另外還對287所（去年298）獨立學院和1264所（去年1289）普通公立專科院校進行了全面系統、客觀公正的科學評價。
2017年中國植物保護專業大學排行榜
| 1 | 中國農業大學 | 5★ | 51 |
| 2 | 南京農業大學 | 5★ | 51 |
| 3 | 華中農業大學 | 4★ | 51 |
| 4 | 浙江大學 | 4★ | 51 |
| 5 | 河南農業大學 | 4★ | 51 |
| 6 | 西北農林科技大學 | 4★ | 51 |
| 7 | 華南農業大學 | 4★ | 51 |
| 8 | 福建農林大學 | 4★ | 51 |
| 9 | 云南農業大學 | 4★ | 51 |
| 10 | 西南大學 | 4★ | 51 |
| 11 | 湖南農業大學 | 3★ | 51 |
| 12 | 貴州大學 | 3★ | 51 |
| 13 | 山東農業大學 | 3★ | 51 |
| 14 | 河北農業大學 | 3★ | 51 |
| 15 | 揚州大學 | 3★ | 51 |
| 16 | 沈陽農業大學 | 3★ | 51 |
| 17 | 山西農業大學 | 3★ | 51 |
| 18 | 安徽農業大學 | 3★ | 51 |
| 19 | 新疆農業大學 | 3★ | 51 |
| 20 | 廣西大學 | 3★ | 51 |
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